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A Universidade Eduardo Mondlane foi fundada no dia 21 de Agosto de 1962, sob a designação de Estudos Gerais Universitários de Moçambique, e em 1968 ascende à categoria de Universidade, sendo então designada Universidade de Lourenço Marques (ULM).
Entre 1963 e 1968 são abertos os cursos na área das Ciências: Física, Química, Geologia, Matemática e Biologia.
A partir de 1976 a ULM passa a designar-se por Universidade Eduardo Mondlane (UEM) e, nessa altura, inicia um processo de reformas curriculares e reestruturação interna. Cada curso de Ciências passa a constituir uma faculdade, passando a existir 5 Faculdades:
- Faculdade de Biologia
- Faculdade de Física
- Faculdade de Química
- Faculdade de Geologia e,
- Faculdade de Matemática
Em 1980 cria-se a Faculdade de Ciências (FC) integrando as Faculdades de Física, Química e Geologia, que se encontravam no mesmo Campus Universitário, e estas passam a ser designadas de Departamentos Académicos da FC. Cinco anos mais tarde, em 1985, a FC cria o Departamento de Ciências Básicas da Faculdade de Ciências “BUSCEP”.
A FC passa por uma reestruturação em 1992 e, a partir deste momento, passa a ser constituída por seis (6) Departamentos Académicos, nomeadamente: Biologia, Física, Química, Geologia, Matemática e Ciências Básicas (BUSCEP). Até então os Departamentos Académicos funcionavam dispersos, alguns no Campus Principal da UEM e outros no Campus da Faculdade de Engenharia.
Após esta reestruturação são elaborados planos de construção do Complexo da Faculdade de Ciências, que permitiria a congregação de todos os Departamentos, consegue-se o financiamento do Banco Mundial, inicíam-se as respectivas obras e em 2000 inaugura-se os primeiros edifícios da faculdade, pertencentes aos Departamentos de Física e Química.
Em 2001, a FC decide encerrar o BUSCEP e renova a sua estrutura orgânica que passa a ser constituída pelos cinco (5) Departamentos Académicos restantes, nomeadamente Biologia, Física, Química, Geologia, Matemática, e um (1) Centro de Investigação, a Estação de Biologia Marítima de Inhaca.
Nos anos que se seguiram a Faculdade imprimiu novos esforços no sentido de proseguir com o seu plano de construção do complexo da faculdade, conseguiu novo financiamento e iniciou as obras de construção de mais um edifício. Este, que foi inaugurado em 2011, acomoda hoje o Departamento de Matemática e Informática e o Departamento de Ciências Biológicas.
Actualmente, a Direcção da Faculdade está instalada no Campus Principal da UEM à semelhança dos seus Departamentos Académicos e Administrativos, com a excepção do Departamento de Geologia que está instalado no Campus da Faculdade de Engenharia.
Directores da Faculdade de Ciências desde 1980
- Eng. António Saraiva de Sousa - 1980 a 1984
- Prof. Doutor Leonid Kapreliantz - 1985 a 1987
- Prof. Doutor Narciso Matos - 1987 a 1990
- Profa. Doutora Fung Dai Kim - 1990 a 1992
- Prof. Doutor Alexandre Maphossa - Janeiro a Agosto de 1992
- Prof. Doutor Orlando Quilambo - 1992 a 1995
- Prof. Doutor Isídro Rafael - 1995 a 2000
- Prof. Doutor Francisco Vieira - 2000 a 2006
- Profa. Doutora Amália Uamusse - 2006 a 2016
- Prof. Doutor Emilio Mosse - 2016 a 2020
- Prof. Doutor Daud Liace Jamal - 2020 até a presente data
